做核酸提取实验的时候,长时间不正确的操作和保存方法确实会导致核酸降解,也就是 DNA/RNA 分子中的碱基和戊糖间的氮糖苷键,或者磷酸二酯键发生水解,导致 DNA/RNA 链发生断裂。
浓度低的 DNA/RNA 会影响实验结果,甚至无法完成设计的实验
一顿操作猛如虎,核酸降解 “我命苦”!
● 提取的样品量要符合试剂的配比,尽量控制样品量达到合适比例
● 每个步骤都要注意充分的混合均匀,避免团块的残留影响实验结果
● 在洗脱时,时间过长或者温度过高,核酸有可能会降解
● 去除环境中 RNase 酶的污染或强有力地抑制其活性
● 可用 EDTA 等金属离子整合剂整合 Mg2+ 以抑制 Dnase 的活性
● 提取时取出样品后立即在低温下研磨裂解细胞,以防 RNA 降解
● 样本切记不可反复冻融,提取的样本要注意在合适的温度保存,长期保存尽量 -80 ℃
● 样本量和裂解液等试剂的配比要尽量控制在合适的范围
● 混合均匀以确保裂解充分和没有团块残留
● 晾干的步骤要充分,否则可能会导致醇类等杂质的残留
● 磁棒振荡幅度太小或混合时间太短,磁珠上有杂质残留会影响磁珠吸附核酸的能力
● 样品量与试剂的配比要控制在一定范围,避免超过裂解能力
● 破碎研磨的步骤处理细节很重要,一定要充分研磨,这是核酸提取的首要条件
● 在洗脱的步骤,使用足量的洗脱液洗脱并充分混匀,避免有团块残存
● 实验耗材要匹配,如不同的吸附柱或磁珠的核酸吸附能力不同,也会影响核酸的得率
其实核酸提取不难,就是时间长、实验要时刻小心才行
有一个「一劳永逸」的办法
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· 实验案例 ·